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提供达40倍加速计算,英特尔联想帮助华大处理测序仪高通量数据

2020-03-03 12:27:47

(文/观察者网 一鸣)3月3日, 联想集团微信公众号发布消息,该公司与英特尔、华大基因正携手加快COVID-19新型冠状病毒的基因组特性分析。

文章称,英特尔、联想提供的技术包括一个大型高性能计算集群,可用于处理从华大DNBSEQ-T7测序系统读取的高通量数据。借此,华大基因将加速对新型冠状病毒的基因组特性研究。

华大DNBSEQ-T7测序仪 图片来源:华大基因

该技术将支持科学家研究病毒的毒性、传播模式等,帮助流行病学及疫苗设计研究。

联想方面称:“通过这项合作,华大基因将得以继续优化其新型冠状病毒检测试剂盒并获取大量有价值的信息。这些信息将有助于确定将来开发有效疫苗或治疗方法的潜在靶标。”

“通过英特尔和联想的共同努力,联想的超算技术支持并优化了‘基因组优化和可扩展性工具’,可为全基因组测序和全外显子测序的计算提供高达40倍的加速,助力华大基因优化计算过程,高效处理数据,更快地生成可靠的基因组分析成果,从而缩短科研和临床观察的时间。”该公司补充道。

据了解,在基因测序工作中,每毫升体液通常会包含数百万个不同的病毒体,而每个病毒体的基因组则包含大约30000个DNA碱基或字母。

华大基因正在对许多感染患者和疑似感染患者的微生物进行基因测序,因此这些研究工作将会生成TB级乃至PB级的海量数据。要想高效地快速处理这些重要数据,就需要采用更为先进的HPC基础架构、计算技术以及优化的基因组分析方法。

实验人员操作DNBSEQ-T7测序仪 图片来源:华大基因

“目前我们对这个新型冠状病毒还有很多不了解的地方。华大基因通过分析病毒基因组数据,加速对感染者的快速识别和基因组特性的研究,而这些工作需要投入巨大的计算资源,这恰恰是我们可以发挥作用的地方。”英特尔公司市场营销集团副总裁兼中国区总经理王锐表示。

联想集团高级副总裁、企业科技集团总裁童夫尧则指出:“来自英特尔及联想的大数据分析和健康与生命科学方面的专家,将整合我们的资源及专业技术,帮助解决目前面临的严峻挑战,推动健康和生命科学的发展进程。”

本文系观察者网独家稿件,未经授权,不得转载。

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来源:观察者网 | 责任编辑:一鸣
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